chlotus tu n'as pas créé de service systemd apparemment.
La commande service rtorrent status renvoie quoi ?
J'ai l'impression que la commande "sudo -u chlotus rtorrent" a foiré :
-u chlotus rtorrent
-bash: -u : commande introuvable
Du coup t'as du le lancer en root et le rtorrent n'a pas pu accéder au fichier .rtorrent.rc puisque le chemin est relatif :
(17:33:54) Could not read resource file: ~/.rtorrent.rc
As-tu bien "sudo" d'installé ?
Sinon connecte toi avec ton user chlotus et lance directement la commande rtorrent pour voir ce qu'il se passe