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Quelques différences :
Si tu as du contenu static (html CSS) Nginx sera plus rapide. Sinon si tu as du contenu php, Nginx s'appuiera sur php-fpm (module externe).
Apache lui traitera le php nativement, du moins avec un module Apache non pas avec un module externe... Il supporte aussi les .htaccess, chacun sont avis moi je trouve pas ça utile.
Finalement le top serai un Apache en fond et un Nginx en cache, à toi de voir aussi avec ton besoin 🙂 si c'est juste perso prend ce qui te semble familier et accessible. Si c'est pour monter une grosse boutique 5000 visiteurs/j je te conseil la solution mixte.
Bon courage.