Pour le groupe primaire, ça dépend de ce à quoi correspondent tes users: s'ils sont uniquement destinés à héberger un site web chacun, alors oui, il n'y a pas trop de risques à modifier leurs groupes primaires. Par contre s'ils sont utilisés au niveau system pour autre chose que l'hébergement d'un site web, je te le déconseille fortement. (on sait jamais
)
Ensuite, pour ton cron, toutes les 5s dans tous les cas c'est vraiment excessif, quelque soit la commande.
Si tu le lances chaque minute (ce qui est déjà beaucoup), tu devrais déjà pouvoir t'en sortir sans soucis.
En soit, si le répertoire que tu "find" est léger, il n'y aura aucun impact sur tes perfs system.
PS: si tu ftp avec un soft depuis win ou mac, tu dois pouvoir faire un clique droit > propriétés > modifier user/group direct depuis l'interface.
