Bien sûr, il suffit de créer ces dossiers dans :
home/user/torrents/
Tu te mets propriétaire de ces dossiers, par exemple :
chown moi:moi /home/user/torrents/soft
Ensuite, tu n'as plus qu'à placer les torrents que tu prends dans le bon dossier, via l'interface rtorrent.
Tu indiques par la suite à Plex, ce qu'il faut qu'il scan, en créant le répertoire à scanner : Musique pour les fichiers musiques, Films pour les films, etc.