Salut
Je passe en vitesse donc excuse la réponse un peu rapide

Pour tes partitions, tu créés une partition par user (et pas de /home), et le script va les reconnaître tout seul (ex: /home/pepsis /home/exrat)
Sur du Raid, il faudra peut-être récupérer les 5% root perdu à la main, ça dépend des circonstances...
Pour le plugin Chat, il est installé par défaut mais surement désactive (de mémoire) car pour un seul users pas la peine de le mettre.
Vas voir pour chaque users:
nano /var/www/rutorrent/conf/users/<username>/plugins.ini
et active ou désactives ce que tu veux dedans
Bon week-end
Ex.
Edit: Après vérification, j'avais oublié de le mettre celui là

C'est corrigé depuis hier soir, il s'installe bien par défaut maintenant mais désactivé. A vous de le mettre en route si vous voulez en passant par plugins.ini pour chaques users.
Pour les anciennes install' auto qui le voudrait:
cd /var/www/rutorrent/plugins/
svn co http://rutorrent-chat.googlecode.com/svn/trunk/ chat
chown -R www-data:www-data /var/www/rutorrent/plugins/chat