si tu veux quand tu vas dans /var/www tu as des dossier (rutorrent,seedbox-manager,share et autres...) Tout ça tu le fou dans un dossier.
Puis tu appliques les permissions du type chown -R www-data:www-data /var/www/rutorrent (cf: tutos)
Ensuite tu fais un dossier dans /var/www pour ton site.
Pour ton site il faut recréer un certificat, c'est pour ca qu'il faut aussi classer les certificats par dossier. Je classe également les logs.
Enfin
nano /etc/nginx/sites-enabled/rutorrent.conf
tu changes
root /var/www/;
par
root /var/www/dossier de la seed;
et tu refais un fichier de config sur la même base que rutorrent mais en modifiant le chemins des répertoires
nano /etc/nginx/sites-enabled/site.conf
Attention, tu dois avoir dans ton fichier de config quelque chose comme
server {
listen 80 default_port;
listen 443 default_port;
sur ton fichier de config du site tu fais
server {
listen 80;
listen 443;