Hello,
As-tu installé ta seedbox sous root ? Si oui, les dossiers sont à root et non à ton utilisateur avec lequel tu tentes de te connecter à FileZilla...
Soit tu fais:
1) chown tonuser:tongroup /dossier/où/tu/veux/deplacer|supprimer
2) chmod 777 /dossier/où/tu/veux/deplacer|supprimer
C'est crade mais ça marchera...